今年，国际顶级学术期刊《Nature》发布了一篇题为《What are the best AI tools for research？》的深度评测报告，报告深入剖析了当前科研领域最受瞩目的五款 AI 模型。
链接：https://www.nature.com/articles/d41586-025-00437-0
这份报告不仅涵盖了从开源到闭源的多种模型类型，也囊括了通用型和专业型 AI 工具，并针对不同的科研应用场景，细致地对比分析了这些主流 AI 模型的优势与不足，为科研人员选择和应用 AI 工具提供了极具价值的参考。
科研必备的大模型 Top 5
DeepSeek-R1：最高性能
DeepSeek-R1 作为一颗新星，在众多 AI 模型中脱颖而出。《Nature》 报告指出，DeepSeek-R1 在性能上已能比肩 OpenAI 的旗舰模型 GPT-4，但 API 使用成本却更具优势。更值得一提的是，DeepSeek-R1 采用了开源权重模式，研究人员可以自由下载并根据自身需求定制模型。这种开放性为预算相对有限的研究团队，开辟了一条构建专业级推理模型的有效路径。
尽管完整模型的运行对计算资源有较高要求，但包括香港中文大学（深圳）的 Benyou Wang 在内的研究人员，正在积极探索开发可在单机环境下运行的 DeepSeek-R1 版本，以进一步降低使用门槛。
DeepSeek-R1 在数学问题求解、代码编写和研究假设生成等领域展现出卓越的性能。其独特之处在于，DeepSeek 公开了模型的完整 “思维过程”，这如同为研究人员提供了一个“黑箱”的可视化窗口，使其能够更深入地理解模型的决策逻辑，从而更好地优化输出结果，提升科研效率。
在医疗诊断领域，Benyou Wang 正在积极探索如何利用 DeepSeek-R1 强大的推理能力，构建从患者初步评估到最终确诊和治疗建议的完整逻辑路径，为智能医疗的发展注入新的动力。
然而，DeepSeek-R1 并非完美无缺。《Nature》 报告也指出了其目前存在的一些问题：首先，模型推理过程相对耗时，这可能会降低在信息快速检索和头脑风暴等任务中的效率；其次，出于对数据安全性的考量，部分国家政府机构已禁止工作人员使用 DeepSeek-R1 聊天机器人；此外，与部分商业竞争对手相比，DeepSeek 在防范有害信息输出方面的机制仍有待完善。（但值得关注的是，这些问题在国内科研场景下的影响可能相对较小。）
DeepSeek-R1 的主要优势：
- 强大的数学推理能力
：能够有效处理复杂的数学计算和逻辑推理问题。 - 卓越的代码能力
：具备优秀的代码编写和调试能力，可辅助软件开发和数据分析工作。 - 透明的推理过程
：具备生成研究假设的能力，且模型思维过程对外透明，便于理解和优化。 - 医疗诊断潜力
：在医疗诊断领域表现出色，有望为临床决策提供清晰可靠的逻辑支持。 - 极具竞争力的性价比
：API 使用成本相对较低，特别适合预算有限的科研团队。
编者按：关于 DeepSeek 在科研中的高阶应用指南，可以参考《DeepSeek：从入门到精通》等相关资料，以便更深入地了解如何将 AI 工具应用于科研工作。文末下载DeepSeek资料
Openai o3-mini：
注：openai最新大模型为GPT5-pro
o3-mini 作为一款免费的推理模型，在科研学习领域也展现出独特的价值。《Nature》 报告指出，o3-mini 在科研学习中主要有以下应用场景：
- 模拟人类推理
：作为一个推理模型，o3-mini 采用 “思维链” (Chain-of-Thought) 的方式逐步解答问题，有效模拟了人类的推理过程，有助于研究人员理解 AI 的决策方式。 - 优秀的科学与数学能力
：在科学和数学领域表现出色，能够胜任复杂的基准测试任务，为科研工作提供可靠的计算支持。 - 技术任务专家
：擅长处理技术性任务，例如解决编码问题和数据重组等，可有效提升科研效率。 - 数学概念分析辅助
：对于分析全新数学证明中的陌生概念有较好的表现，能够辅助数学研究，但目前仍无法完全替代专业数学家的工作。
值得关注的是，o3-mini 是一款完全免费的推理工具，只需注册即可使用。OpenAI 还推出了名为 “深度研究” 的付费功能，用户可以通过该功能从海量互联网信息中抓取并整理信息，自动生成带有参考文献引用的研究报告，其功能类似于进行文献综述，极大地简化了科研人员的信息收集和整理工作。
对于需要进行辅助编程的研究人员而言，在 Cursor 等代码编辑器中集成 o3-mini 也是一个非常不错的免费选择，可以有效提升编程效率。
Llama：科研社区的实用工具
Meta AI 旗下的 Llama 系列模型，是开源权重模型的代表之作。《Nature》 报告显示，Llama 系列模型在 Hugging Face 平台上的累计下载量已超过 6 亿次，在科研社区中拥有极高的认可度和广泛的应用基础。
Llama 的主要优势在于支持本地或机构服务器的部署和运行，这对于需要处理敏感研究数据的科研项目而言至关重要。尽管访问 Llama 模型通常需要经过权限申请，但其高度的灵活性和出色的数据安全性，使其成为众多研究人员进行本地化 AI 部署的首选工具。
目前，Llama 已在多个科研领域取得了成功应用：
- 材料科学
：用于晶体结构预测研究，加速新材料发现进程。 - 量子计算
：用于量子计算机性能模拟，推动量子计算技术发展。 - 自然语言处理
：用于专业领域语言的理解和处理，提升专业文献的分析效率。 - 人工智能
：作为各类定制化科研模型的基础架构，为科研创新提供坚实支撑。
有研究者在 “硅基流动” 平台上体验了 Llama 70B 模型，认为其运行速度非常快，但在答案质量方面，可能略逊于 DeepSeek-R1（这或许反映了通用模型与推理模型之间的侧重差异）。因此，Llama 或许更适合应用于知识点快速问答等场景，例如，研究人员可以构建个人知识库，并利用 Llama 进行快速检索，充分发挥其速度优势，提升信息获取效率。
Claude：代码与技术写作的专业助手
Anthropic 公司开发的 Claude 3.5 Sonnet 模型，在代码编写和技术写作领域展现出强大的实力。《Nature》 报告指出，Claude 3.5 Sonnet 不仅能确保专业术语的准确运用，还能有效提升科技文献和技术文档的可读性，是科研人员进行代码开发和学术写作的得力助手。
Claude4 Sonnet 具备以下特色功能：
- 代码能力
：强大的代码编写能力，尤其受到硅谷软件开发工程师的青睐。 - 多模态处理
：支持同时处理和解读图表、图像、文本等多种类型的信息，实现更全面的信息整合与分析。 - 远程控制
：具备远程操作用户计算机的能力，并能控制其他应用程序，实现更智能化的工作流程。 - 写作优化
：在保证技术内容准确性的前提下，有效优化写作风格和可读性，提升学术论文和技术文档的质量。 - 应用场景
：尤其适合撰写科研基金申请书和技术文档等专业性文稿，助力科研项目成功立项和成果高效转化。
有用户评价 Claude 3.5 Sonnet 在代码编写和技术写作方面表现非常出色，但笔者尚未实际体验过。（据一些评测信息显示，Claude 3.5 Sonnet 的使用成本相对较高，而 DeepSeek-R1 在代码编写能力方面也具备很强的竞争力）。
OLMo：完全开源的科研新选择
对于希望深入探究 AI 模型内部运作机制的研究人员而言，OLMo 2 或许是更理想的选择。《Nature》 报告认为，OLMo 2 是一个真正意义上完全开源的模型，为科研人员提供了前所未有的透明度和可控性。
OLMo 2 不仅开源了模型权重，还完整地公开了模型的训练数据集和模型评估代码。这种极致的开放性，为研究人员深入了解模型内部工作原理、追踪模型偏差、分析算法决策过程提供了可能。尽管 OLMo 2 的使用门槛相对较高，但随着相关免费培训课程的普及，其入门难度正在逐步降低，越来越多的研究者有望从中受益。
OLMo 2 的核心优势包括：
- 完全开源
：提供完整的训练数据集、模型评估代码和模型架构，实现科研成果的开放共享。 - 模型可解释性
：支持对模型偏差进行深入追踪和分析，提升模型的可信度和可靠性。 - 决策透明度
：算法决策过程完全透明，方便研究人员进行深入分析和改进。 - 科研价值
：尤其适合用于 AI 伦理和偏见等前沿领域的相关研究，推动人工智能技术的健康发展。
总结与展望
诚然，选择合适的 AI 大模型仅仅是科研提效的第一步。科研人员还需要不断学习和实践，掌握高级提示词 (Prompt Engineering) 技巧，并将 AI 工具创造性地整合到日常科研工作流程中，才能最大限度地释放 AI 的潜力，真正实现科研效率的飞跃。 随着 AI 技术的持续演进，我们有理由相信，未来的科研工作将更加智能、高效和富有创新性。
《DeepSeek从入门到精通-清华大学》 ：点击阅读原文下载
