Isomorphic Labs首席科学家分享:AlphaFold 3破解生命密码,当年「第37手」的创造力,如今我们用来编写新药

智能情报所 2025-07-23 18:29

与 Isomorphic Labs 首席人工智能官 Max Jaderberg 在 RAAIS 2025 上的深度分享。

AIR STREET PRESS 与 NATHAN BENAICH

2025年7月22日

在今年的 RAAIS 大会上,来自 Isomorphic Labs 的 Max Jaderberg 发表了一场堪称 AlphaGo 精神续作的演讲。

这一次,棋盘不再是 19x19 的网格,而是复杂无比的人体。

赌注,则是药物发现乃至人类健康的未来。

豪言壮语:攻克所有疾病

Isomorphic Labs,这家脱胎于 DeepMind 的生物科技公司,提出了一个极其宏大的使命——攻克所有疾病

这并非一句比喻,而是一场系统层面的豪赌。他们坚信,曾破解围棋的模型,也必将破解生物学的密码。

这不仅要将传统实验室的流程数字化,更要将生物分子的复杂动态,编码为机器可以学习和理解的全新语言。

AlphaGo 的意义在于,它让 AI 学会了创造前所未有的制胜策略。而 Isomorphic Labs 的目标,是让 AI 发明出人类在实验室中永远无法触及的全新药物。

这无异于一次登月计划,其核心信念是:生物学本质上是一门信息科学,而机器学习,正是我们破译这门语言的最佳途径

灵感源于巅峰对决

Jaderberg 本人深耕于强化学习领域。当年在 DeepMind,正是强化学习,造就了 AlphaGo 那震惊世界的「第 37 手」。

那一步棋并非暴力计算的产物,而是在巨大的搜索与反馈空间中,自然涌现的创造力

它向 Max 证明,神经网络不仅能模仿和预测,更能创造和发明

然而,生物学远比游戏复杂,它没有完美的模拟器。真实世界响应缓慢、充满随机性,且研究成本极其高昂。

如果说围棋是 AI 的试验场,那么生物学就是对其泛化能力的终极考验。

尽管领域不同,但目标一致:构建一个能支撑推理和创造的世界模型。只不过在生物学的棋盘上,一切都是不可见的。

逆转反摩尔定律

长期以来,药物研发被一个残酷的反摩尔定律所困:研发投入持续暴增,但成功上市的新药数量却不断萎缩

这并非业界不够努力,而是因为生命系统实在太复杂。

一个蛋白质的功能由其三维结构决定,结构又由其氨基酸序列决定,而这一切又处在一个我们无法用公式描述的、与其他分子相互作用的「动态浓汤」之中。

但另一边,算力仍在以前所未有的速度增长。以 Transformer 为代表的 AI 模型已经证明,只要有足够的数据和巧妙的架构,就有可能逆转复杂性带来的无序和熵增

Isomorphic Labs 的未来,就建立在这样一次巨大的认知套利之上:以计算机的模拟推理,取代实验室的反复试错。最终,从混沌的生命现象中,发掘出其内在的秩序。

从 AlphaFold 到 AlphaFold 3:模拟生命之舞

生物科技领域无人不晓 AlphaFold 2,它在 2021 年实现了以接近实验的精度预测蛋白质结构,这是一项里程碑式的突破。

但蛋白质并非孤立存在。它们与 DNA、RNA 及小分子药物的相互作用,才真正定义了健康与疾病。

于是,AlphaFold 3 应运而生。这也许是 Isomorphic Labs 迄今最重要的成果。

Jaderberg 揭示了团队如何扩展其神经网络架构,以模拟分子间的复杂互动。其核心创新是一种名为「PairFormer」的模块。

它不像语言模型那样处理一维序列,而是专注于在二维的交互网格上,对分子间的关系进行推理

这意味着 AlphaFold 3 不仅能预测一个蛋白质长什么样,更能模拟当它遇到药物分子或 DNA 片段时,会如何相互行为和响应。

Isomorphic 的独特之处

在 Jaderberg 的阐述中,Isomorphic Labs 的特别之处不仅在于模型,更在于其独特的公司设计哲学。

许多公司只是将 AI 作为生物研究的辅助工具,而 Isomorphic Labs 则是从第一性原理出发,重新设计整个研发技术栈

在这里,AI 模型的开发、大规模推理所需的基础设施,以及对生物学意义的解读,从一开始就是被协同设计的。

Jaderberg 认为,AI 模型不应被视为科学家的工具,它们本身就是科学家,是内嵌于强大算力之中的推理智能体

Isomorphic Labs 的终极目标,就是让这些智能体,能用生物学的语言流畅地思考。

下一章:从模拟到编写

凭借首轮超过 6 亿美元的外部融资,Isomorphic Labs 正全力开启新篇章。

公司正以实际的临床应用为目标,构建其 AI 原生的药物设计平台,真实的临床试验已然近在咫尺。

它已和医药巨头礼来、诺华达成数十亿美元的合作,在肿瘤、心血管及神经退行性疾病领域,共同进行多靶点药物的探索。

随着首席医疗官 Ben Wolf 博士的加入和美国研发中心的设立,Isomorphic 正在构建一个全栈式、AI 优先的未来型生物技术公司。

当然,整个领域也并未停歇。下一个前沿,将不再局限于预测蛋白质结构或药物如何结合。

真正的未来,是建立完整的生物系统模型。像 Profluent 这样的新兴公司,正借鉴前沿大模型的思路,直接构建能从零开始生成全新功能蛋白的 AI

这场竞赛的目标,已不再是模拟生物学,而是要亲手编写生物学。


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